Совет Фонда является постоянно действующим коллегиальным органом и формируется в количестве не менее 5 человек из числа государственных гражданских служащих Ямало-Ненецкого автономного округа. Персональный состав Совета Фонда утверждается и изменяется приказом учредителя Фонда – департаментом строительства и жилищной политики Ямало-Ненецкого автономного округа.